Laboratoř elektromagnetické kompatibility je zaměřena na měření elektromagnetického rušení a testování elektromagnetické odolnosti. Pro měření elektromagnetického rušení je laboratoř vybavena měřicím přijímačem, příslušnými měřicími anténami a částečně (případně plně) bezodrazovou komorou. Dále je zde pak i k dispozici jednofázová síť LISN. V laboratoři je také možné provádět testy elektromagnetické odolnosti vůči ESD výbojům, surge pulzům, skupinám pulzů (burst) a poklesům či výpadkům napájecího napětí.